2004年5月国药集团医药物流有限公司注册成立，注册资本3亿元人民币，是国药控股有限公司的全资子公司，是国家一级抢险、救灾、军需、外援等药械商品的特种储备企业。实施24小时值班制已有50多年历史，成为第一时间急供药械，拯救生命、维护社会安定的生力军，被誉为“关爱生命的守护神”。

北京物流中心通过北京市药品监督管理局检查，取得《药品经营许可证》、《医疗器械经营企业许可证》、《药品经营质量管理规范认证证书》，于2005年获得中成药、化学原料药、化学药制剂、抗生素、生化药品、生物制品、麻醉药品、精神药品（一、二类）等药品的第三方储存和配送资质。

 
北京物流中心占地27000平方米，仓储面积20000平方米，库区全部采用中央空调和温湿度自动实时监控系统，药品分别储存于阴凉库、低温库（冷藏库、冷冻库）。库区设置自动立体库储位，重型料架储位，零散储位。

北京物流中心采用先进的ERP、WMS软件，AS/RS、电子标签、RF、SPS、条型码等设备和技术，并配备近60辆包括救护车、冷藏车在内的各种运输车辆，充分满足北京市内收货、送货需求，现配送已覆盖北京市1500多家医疗机构、商业客户。所有冷藏车辆经过专业验证，严格按照运输要求的温度范围控制车内温度，所有车辆安装GPS系统，实时监控车辆位置、车速及车厢内温度情况。与中铁快运、邮局、EMS、航空货运、集装箱运输公司签订有严格的货运代理协议，根据户主需求，将货物门到门的送达全国各地。公司配有全套完善的安全保障系统，包括安防系统、报警系统、消防系统、门禁系统、供电系统和断电保护系统。

北京物流中心建立有完整的质量管理体系，包括公司级质量方针、质量目标、一级质量手册、二级控制程序文件、三级作业流程、作业指导书等，并有完善的风险控制体系。

目前国药物流为多家国内外生产企业、药品流通企业、零售连锁企业提供储存和配送业务。国药物流使用最新的技术、采用最优方法、制定新的质量标准，成功引进ISO9001质量管理体系，为客户提供“专业、量身、弹性和速度”的第三方物流服务。